Table 6 Details of binding affinity and interaction of some selected compounds with α-glucosidase
Sr. No | Compound | Binding affinity (kcal/mole) | No. of H. Bonds | Interacting residues |
|---|---|---|---|---|
1 | Acarbose (standard) | −7.1 | 7 | PRO A:433, MET A:435, LYS A:436, ASP A:379, ASP A:381, VAL A:383, ASP A:382, ASP A:59, ASN A:58, ASN A:61, ARG A:17, ILE A:27, TRP A:434 |
2 | (3S,7E,9S)-9-Hydroxy-4,7-megastigmadien-3-one 9-glucoside | −8.1 | 4 | GLU A:119, LYS A:118, GLU A:157, ARG A:123, TRP A:128, ASP A:124, TYR A:126, ILE A:204, ASN A:171, TRP A:172, LYS A:206, GLU A:173, ILE A:127, ALA A:208, PHE A:210, HIS A:129 |
3 | (5a,8b,9b)-5,9-Epoxy-3,6-megastigma | −6.1 | N/A | GLY A:274, TRP A:6, ASN A:277, ALA A:247, ILE A:251, PHE A:246, LYS A:242, THR A:253, ASN A:245, PHE A:276 |
4 | Ixocarpalactone A | −7.9 | 2 | GLU A:283, GLY A:286, GLY A:259, PRO A:233, LEU A:219, PRO A:216, PRO A:214, VAL A:222, GLU A:226, PHE A:225, MET A:229, ASN A:258, PHE A:282, LEU A:287 |
5 | Plumerubroside | −7.7 | 3 | ASN A:227, ASN A:275, PHE A:276, LYS A:242, GLY A:274, GLU A:271, LYS A:7, TRP A:6, ALA A:247, TYR A:249, ASP A:250, ILE A:251, MET A:252, PHE A:246 |
6 | Isoferulic acid | −5.9 | 3 | ASN A:316, GLY A:317, TRP A:318, ALA A:270, TRP A:6, VAL A:269, ASN A:277, PHE A:276, ASN A:275, GLY A:274, LYS A:242, GLU A:271, LYS A:7 |